Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTNP21246 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTNP21246 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PTNP21246 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTNP21246 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTNP21246 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTNP21246 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTNP21246 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTNP21246 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTNP21246 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTNP21246 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTNP21246 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTNP21246 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTNP21246 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTNP21246 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTNP21246 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTNP21246 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms