Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NTF3P20783 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTF3P20783 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTF3P20783 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTF3P20783 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NTF3P20783 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NTF3P20783 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NTF3P20783 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NTF3P20783 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NTF3P20783 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms