Protein–RNA interactions for Protein: P20340

RAB6A, Ras-related protein Rab-6A, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6AP20340 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB6AP20340 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB6AP20340 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB6AP20340 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms