Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM21P19474 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM21P19474 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM21P19474 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms