Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ATF3P18847 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATF3P18847 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATF3P18847 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ATF3P18847 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATF3P18847 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
ATF3P18847 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ATF3P18847 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
ATF3P18847 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF3P18847 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
ATF3P18847 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ATF3P18847 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ATF3P18847 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ATF3P18847 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
ATF3P18847 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATF3P18847 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATF3P18847 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATF3P18847 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ATF3P18847 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ATF3P18847 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ATF3P18847 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATF3P18847 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATF3P18847 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ATF3P18847 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ATF3P18847 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ATF3P18847 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ATF3P18847 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ATF3P18847 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms