Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB5P18084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB5P18084 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB5P18084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms