Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN1P18031 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN1P18031 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms