Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GATA1P15976 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GATA1P15976 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GATA1P15976 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA1P15976 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA1P15976 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA1P15976 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GATA1P15976 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms