Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC130P13994 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC130P13994 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms