Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEACAM1P13688 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEACAM1P13688 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms