Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA4P13612 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA4P13612 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA4P13612 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms