Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VPREB1P12018 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VPREB1P12018 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms