Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFP11831 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFP11831 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFP11831 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFP11831 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRFP11831 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SRFP11831 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFP11831 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFP11831 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFP11831 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFP11831 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRFP11831 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRFP11831 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRFP11831 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRFP11831 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRFP11831 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRFP11831 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRFP11831 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRFP11831 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRFP11831 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRFP11831 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms