Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF1P10914 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF1P10914 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF1P10914 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF1P10914 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF1P10914 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF1P10914 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF1P10914 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF1P10914 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF1P10914 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF1P10914 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF1P10914 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF1P10914 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF1P10914 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF1P10914 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF1P10914 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF1P10914 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF1P10914 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF1P10914 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF1P10914 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF1P10914 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF1P10914 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF1P10914 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF1P10914 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF1P10914 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF1P10914 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF1P10914 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms