Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GLI3P10071 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GLI3P10071 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GLI3P10071 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GLI3P10071 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GLI3P10071 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GLI3P10071 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
GLI3P10071 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GLI3P10071 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GLI3P10071 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GLI3P10071 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GLI3P10071 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GLI3P10071 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
GLI3P10071 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GLI3P10071 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GLI3P10071 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GLI3P10071 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GLI3P10071 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GLI3P10071 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GLI3P10071 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GLI3P10071 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GLI3P10071 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GLI3P10071 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GLI3P10071 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 424.5 ms