Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
OPN1MW3P0DN78 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OPN1MW3P0DN78 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OPN1MW3P0DN78 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms