Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRGAP2CP0DJJ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SRGAP2CP0DJJ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRGAP2CP0DJJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRGAP2CP0DJJ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms