Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRR35P0CG20 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRR35P0CG20 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRR35P0CG20 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms