Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM228BP0C875 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM228BP0C875 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM228BP0C875 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms