Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC175P0C221 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC175P0C221 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms