Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBP1P09455 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP1P09455 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP1P09455 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBP1P09455 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RBP1P09455 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBP1P09455 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBP1P09455 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBP1P09455 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP1P09455 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP1P09455 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBP1P09455 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBP1P09455 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP1P09455 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP1P09455 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP1P09455 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBP1P09455 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBP1P09455 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms