Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MMP10P09238 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP10P09238 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP10P09238 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP10P09238 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MMP10P09238 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP10P09238 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP10P09238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP10P09238 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP10P09238 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP10P09238 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MMP10P09238 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP10P09238 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP10P09238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MMP10P09238 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP10P09238 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP10P09238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MMP10P09238 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MMP10P09238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP10P09238 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP10P09238 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP10P09238 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP10P09238 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MMP10P09238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP10P09238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MMP10P09238 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP10P09238 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms