Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSLP07711 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSLP07711 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSLP07711 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSLP07711 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSLP07711 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSLP07711 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSLP07711 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSLP07711 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSLP07711 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSLP07711 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSLP07711 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSLP07711 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSLP07711 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms