Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYL1P05976 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYL1P05976 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYL1P05976 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYL1P05976 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYL1P05976 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYL1P05976 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYL1P05976 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYL1P05976 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYL1P05976 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYL1P05976 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYL1P05976 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYL1P05976 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYL1P05976 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms