Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYBBP04839 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYBBP04839 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYBBP04839 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYBBP04839 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYBBP04839 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYBBP04839 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYBBP04839 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYBBP04839 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYBBP04839 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYBBP04839 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYBBP04839 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYBBP04839 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYBBP04839 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms