Protein–RNA interactions for Protein: P02745

C1QA, Complement C1q subcomponent subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QAP02745 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1QAP02745 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C1QAP02745 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1QAP02745 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1QAP02745 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1QAP02745 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QAP02745 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QAP02745 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QAP02745 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QAP02745 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1QAP02745 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1QAP02745 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1QAP02745 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1QAP02745 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QAP02745 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QAP02745 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QAP02745 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1QAP02745 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QAP02745 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1QAP02745 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1QAP02745 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1QAP02745 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms