Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CST1P01037 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CST1P01037 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CST1P01037 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
CST1P01037 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CST1P01037 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CST1P01037 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CST1P01037 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CST1P01037 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CST1P01037 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CST1P01037 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CST1P01037 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CST1P01037 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CST1P01037 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CST1P01037 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CST1P01037 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CST1P01037 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CST1P01037 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CST1P01037 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms