Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SERPINA3P01011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERPINA3P01011 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms