Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
F13A1P00488 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
F13A1P00488 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
F13A1P00488 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F13A1P00488 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F13A1P00488 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F13A1P00488 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F13A1P00488 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F13A1P00488 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
F13A1P00488 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F13A1P00488 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
F13A1P00488 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F13A1P00488 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F13A1P00488 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F13A1P00488 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
F13A1P00488 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
F13A1P00488 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
F13A1P00488 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F13A1P00488 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F13A1P00488 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F13A1P00488 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
F13A1P00488 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F13A1P00488 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F13A1P00488 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
F13A1P00488 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
F13A1P00488 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
F13A1P00488 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
F13A1P00488 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F13A1P00488 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F13A1P00488 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
F13A1P00488 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
F13A1P00488 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
F13A1P00488 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
F13A1P00488 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms