Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX11BO96011 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX11BO96011 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms