Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRUB2O95900 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRUB2O95900 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRUB2O95900 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms