Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POP4O95707 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POP4O95707 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POP4O95707 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POP4O95707 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP4O95707 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP4O95707 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POP4O95707 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP4O95707 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP4O95707 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP4O95707 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POP4O95707 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POP4O95707 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POP4O95707 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POP4O95707 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POP4O95707 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POP4O95707 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POP4O95707 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP4O95707 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP4O95707 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms