Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
POLR1AO95602 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
POLR1AO95602 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
POLR1AO95602 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
POLR1AO95602 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms