Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGDSO95455 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGDSO95455 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGDSO95455 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGDSO95455 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TGDSO95455 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGDSO95455 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGDSO95455 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGDSO95455 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGDSO95455 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TGDSO95455 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGDSO95455 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGDSO95455 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGDSO95455 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGDSO95455 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGDSO95455 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGDSO95455 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGDSO95455 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGDSO95455 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms