Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNFRSF6BO95407 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFRSF6BO95407 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms