Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF4AO95239 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF4AO95239 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF4AO95239 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms