Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DKK1O94907 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DKK1O94907 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DKK1O94907 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DKK1O94907 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DKK1O94907 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK1O94907 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DKK1O94907 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DKK1O94907 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DKK1O94907 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DKK1O94907 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms