Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ALDH1A2O94788 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ALDH1A2O94788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALDH1A2O94788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms