Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP9O75884 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RBBP9O75884 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RBBP9O75884 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms