Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM1O75626 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM1O75626 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM1O75626 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms