Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC4O75487 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC4O75487 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC4O75487 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC4O75487 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC4O75487 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC4O75487 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC4O75487 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC4O75487 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC4O75487 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC4O75487 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC4O75487 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC4O75487 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms