Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F6O75461 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F6O75461 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F6O75461 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F6O75461 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F6O75461 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2F6O75461 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2F6O75461 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2F6O75461 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F6O75461 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2F6O75461 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2F6O75461 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2F6O75461 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2F6O75461 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms