Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP5O75197 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP5O75197 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP5O75197 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP5O75197 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP5O75197 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP5O75197 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP5O75197 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP5O75197 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP5O75197 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRP5O75197 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP5O75197 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP5O75197 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP5O75197 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP5O75197 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP5O75197 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP5O75197 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP5O75197 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP5O75197 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP5O75197 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP5O75197 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP5O75197 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRP5O75197 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRP5O75197 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRP5O75197 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP5O75197 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP5O75197 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP5O75197 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP5O75197 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP5O75197 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRP5O75197 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LRP5O75197 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP5O75197 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP5O75197 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms