Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
DEPDC5O75140 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DEPDC5O75140 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DEPDC5O75140 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
DEPDC5O75140 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DEPDC5O75140 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DEPDC5O75140 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
DEPDC5O75140 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
DEPDC5O75140 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms