Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCN2BO60939 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCN2BO60939 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms