Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM17BO60830 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TIMM17BO60830 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms