Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRPX2O60687 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRPX2O60687 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms