Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GMDSO60547 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GMDSO60547 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GMDSO60547 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GMDSO60547 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GMDSO60547 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GMDSO60547 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GMDSO60547 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GMDSO60547 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GMDSO60547 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GMDSO60547 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms