Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VEGFDO43915 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFDO43915 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms