Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC28A2O43868 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC28A2O43868 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms